ПРЕДИСЛОВИЕ ..................................................... 5

                              ЧАСТЬ 1
                    ЭКОЛОГИЧЕСКАЯ МИКРОБИОЛОГИЯ

ГЛАВА 1  ГИДРОТЕРМЫ ДОЛИНЫ ГЕЙЗЕРОВ И БАЙКАЛЬСКОЙ РИФТОВОЙ 
ЗОНЫ ........................................................... 13
1.1  Новые грамотрицательные, образующие эндоспоры бактерии,
     выделенные из термальных полей и источников Долины
     Гейзеров (Камчатка) (И.С. Андреева, И.В. Морозов,
     О.В. Морозова, Е.И. Рябчикова, И.В. Саранина,
     Е.К. Емельянова, Л.И. Пучкова, В.В. Власов, В.Е. Репин) ... --
1.2  Bacillus thuringiensis Долины Гейзеров (Камчатка).
     Ферментативная и антимикробная активность
     (И.С. Андреева, Н.И. Печуркина, Л.И. Бурцева,
     Г.В. Калмыкова, Л.И. Пучкова, И.В. Саранина,
     В.Е. Репин) ............................................... 23
1.3  Геохимические особенности щелочных гидротерм
     Баргузинской долины. Биогенное минералообразование в
     цианобактериальных матах. Изотопный состав углерода
     микробных матов. Перераспределение элементов между
     минеральной и органической частями микробного мата
     (Е.В. Лазарева, А.В. Брянская, С.М. Жмодик,
     В.А. Пономарчук, Д.Д. Бархутова, О.П. Таран,
     Д.В. Семенова, Ю.П. Колмогоров) ........................... 33
1.4  Разнообразие и функциональная активность микробных
     сообществ наземных гидротерм Байкальской рифтовой
     зоны (Б.Б. Намсараев, Д.Д. Бархутова, 3.Б. Намсараев,
     А.В. Брянская, Т.Г. Банзаракцаева, Е.В. Лаврентьева,
     Э.В. Данилова) ............................................ 45
1.5  Brevibacillus barguzinii sp. nov. - новая, образующая
     эндоспоры грамотрицательная эубактерия, выделенная из
     термального источника Змеиный (Баргузинский  заповедник,
     Россия) (В.Е. Репин, И.С. Андреева, О.В. Морозова,
     Е.И. Рябчикова, Е.К. Емельянова, Л.И. Пучкова) ............ 74
1.6  Новый вид бактерий Roseomonas baikalica sp. nov.,
     обнаруженный в древних осадочных породах дна озера
     Байкал (И.С. Андреева, Н.И. Печуркина, О.В. Морозова,
     Е.И. Рябчикова, С.И. Беликов, Л.И. Пучкова,
     Е.К. Емельянова, Т. Торок, В.Е. Репин) .................... 78
1.7  Роль микроорганизмов в накоплении платины и других
     металлов океаническими железомарганцевыми конкрециями
     (С.М. Жмодик, Д.К. Белянин, А.А. Богуш) ................... 85

ГЛАВА 2  МИНЕРАЛИЗОВАННЫЕ ОЗЕРА ЮГА СИБИРИ И ЗАБАЙКАЛЬЯ ....... 102
2.1  Общее описание Меромиктических озер юга Сибири
     (А.Г. Дегерменджи, Д.Ю. Рогозин) ......................... ---
2.2  Структура и динамика микробного сообщества серного
     цикла в озерах Шира и Шунет (Д.Ю. Рогозин,
     М.Ю. Трусова, А.Г. Дегерменджи) .......................... 104
2.3  Скорости микробных процессов цикла серы и углерода в
     озерах Шира и Шунет (Д.Ю. Рогозин, А.Г. Дегерменджи) ..... 119
2.4  Математическое моделирование вертикальной структуры
     стратифицированного водоема. Гидрофизические модели
     (В.М. Белолипецкий, П.В. Белолипецкий,
2.5  Новая одномерная вертикальная модель меромиктического
     соленого озера Шира (Россия, Хакасия): принципы, 
     уравнения, модельные расчеты С.Н. Генова) ................ 126
     (И.Г. Прокопкин, А.Г. Дегерменджи, Д.Ю. Рогозин) ......... 150
2.6  Экологический прогноз динамики серного цикла в озерах
     Шира и Шунет с помощью математических моделей
     (Д.Ю. Рогозин, И.Г. Прокопкин, А.Г. Дегерменджи) ......... 163
2.7  Геохимическая и микробиологическая характеристика
     соленых экосистем Новосибирской области (А.В. Брянская,
     О.П. Таран, В.А. Симонов, Е.В. Лазарева, А.С. Розанов,
     С.Е. Пелыпек, В.Н. Пармон, Н.А. Колчанов) ................ 168
2.8  Разнообразие и функциональная активность микробных
     сообществ содово-соленых озер Центральной Азии
     (Б.Б. Намсараев, Л.П. Козырева, 3.Б. Намсараев,
     А.В. Брянская, С.П. Бурюхаев, Д.Д. Цыренова,
     Е.Н. Болдарева, В.М. Горленко) ........................... 176

ГЛАВА 3  ОБЩИЕ ПРОБЛЕМЫ ЭКОЛОГИЧЕСКОЙ БИОЛОГИИ ................ 199
3.1  Что новое привнесли микроорганизмы в теорию эволюции
     (В.Е. Репин, В.В. Власов) ................................ ---
3.2  Точка отсчета микробной эволюции: возникновение
     первичных экосистем на Земле с позиции системной
     концепции зарождения биосферы (В.Н. Компаниченко) ........ 205
3.3  Микроорганизмы многолетнемерзлых пород как уникальные
     объекты эволюции (А.В. Брушков, М. Утсуми, К. Асано,
     М. Танака, М. Фукуда, В.Е. Репин) ........................ 215
3.4  Исследование адаптации к экстремальным условиям
     культивируемых эубактерий о. Короля Георга, Антарктида
     (О.В. Морозова, И.С. Андреева, В.И. Жираковский,
     Е.К. Емельянова, Н.И. Печуркина, Л.И. Пучкова,
     Т.П. Камынина, В.Е. Репин, В.В. Власов) .................. 221
3.5  Микроорганизмы позднего плейстоцена (В.Е. Репин,
     В.Г. Пугачев, О.С. Таранов, Е.К. Емельянова,
     О.Д. Тотменина, С.Ф. Орешкова, Л.И. Пучкова,
     Е.И. Рябчикова, И.С. Андреева, А.В. Брушков) ............. 230

                              ЧАСТЬ 2
          БИОТЕХНОЛОГИЧЕСКАЯ И МЕДИЦИНСКАЯ МИКРОБИОЛОГИЯ

ГЛАВА 4  БИОРЕМЕДИАЦИЯ ОТХОДОВ. БИОТЕХНОЛОГИЧЕСКИЕ АСПЕКТЫ .... 239
4.1  Возможности применения микроорганизмов в переработке
     отходов производства биодизельного топлива с целью
     получения химических веществ (К.Н. Сорокина,
     А.С. Розанов, С.Е. Пельтек, Н.А. Колчанов, В.Н. Пармон) ... --

ГЛАВА 5  СОЦИАЛЬНО ЗНАЧИМЫЕ И ТРАНСМИССИВНЫЕ ЗАБОЛЕВАНИЯ ...... 247
5.1  Молекулярная эпидемиология туберкулеза (М.А. Дымова,
     М.Л. Филипенко) .......................................... ---
5.2  Генотипирование изолятов и штаммов вируса клещевого
     энцефалита, выявленных в природных очагах лесопарковой
     зоны Новосибирского научного центра (С.Е. Ткачев,
     В.В. Панов, В.В. Бахвалова) .............................. 259
5.3  Определение и сравнительный анализ последовательностей
     генов ospA и р83/100 западносибирских изолятов
     В. afzelii и В. garinii (H.В. Фоменко, Ю.В. Сабитова,
     Н.А. Гольцова, М.А. Хаснатинов, Ж. Батаа,
     О.В. Стронин) ............................................ 266
5.4  Генетическое разнообразие эрлихий и анаплазм на
     территории азиатской части России (В.А. Рар,
     Н.Н. Ливанова, Н.М. Пуховская, И.В. Козлова,
     Л.И. Иванов) ............................................. 286
5.5  Паразитарные системы природноочаговых трансмиссивных
     заболеваний человека Северного Зауралья (Н.Н. Ливанова,
     С.Г. Ливанов, В.А. Рар, С.Е. Ткачев) ..................... 297

                              ЧАСТЬ 3
                    ТЕОРЕТИЧЕСКАЯ МИКРОБИОЛОГИЯ

ГЛАВА 6  КОМПЬЮТЕРНЫЙ АНАЛИЗ И МОДЕЛИРОВАНИЕ БАКТЕРИАЛЬНЫХ
МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТМЧЕСКИХ СИСТЕМ ............................... 315
6.1  Анализ эволюции в семействах белоккодирующих генов у
     архей рода Pyrococcus при адаптации к высоким давлениям
     океанических глубин (А.В. Гунбин, Д.А. Афонников,
     Е.В. Болдырева, Н.А. Колчанов) ........................... ---
6.2  Влияние Neisseria gonorrhoeae на жизнеспособность
     клеток хозяина: реконструкция генной сети
     (О.А. Подколодная) ....................................... 330
6.3  Моделирование коэволюции одноклеточных гаплоидных
     организмов с помощью программного комплекса
     "Эволюционный конструктор" (С.А. Лашин, В.В. Суслов,
     Ю.Г. Матушкин, Н.А. Колчанов) ............................ 347
6.4  Компьютерный генетический конструктор: математическое
     моделирование генетических и метаболических подсистем
     Е. coli (В.А. Лихошвай, Т.М. Хлебодарова,
     А.В. Ратушный, С.А. Лашин, И.И. Турнаев,
     О.А. Подколодная, Е.А. Ананько, О.Г. Смирнова,
     С.С. Ибрагимова, Н.А. Колчанов) .......................... 376
6.5  Компьютерный ресурс "Генетический конструктор" для
     моделирования молекулярно-генетических процессов в
     бактериальной клетке: анализ циклической генной сети
     (В.А. Лихошвай, Т.М. Хлебодарова, Н.А. Колчанов) ......... 392
6.6  Экспериментально-компьютерное конструирование и анализ
     бактериальных геносенсоров для детекции токсичности
     окружающей среды (Т.М. Хлебодарова, Н.В. Тикунова,
     В.А. Лихошвай, А.В. Качко, Т.Ю. Степанова,
     Д.Ю. Ощепков, А.В. Задорожный, Ю.Г. Матушкин,
     Н.А. Колчанов) ........................................... 404

СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ ............................................. 423
СВЕДЕНИЯ О ФИНАНСОВОЙ ПОДДЕРЖКЕ ТЕМАТИЧЕСКИХ ИССЛЕДОВАНИЙ, 
ПРОВЕДЕННЫХ В РАМКАХ РАЗДЕЛОВ МОНОГРАФИИ, А ТАКЖЕ
БЛАГОДАРНОСТИ АВТОРОВ ......................................... 465
СВЕДЕНИЯ ОБ АВТОРАХ ........................................... 470