Действительный член (1979), член-корреспондент (1968) АН СССР, доктор химических наук (1965), профессор (1968).

В Сибирском отделении с 1959 г.: зав. лабораторией механизма органических реакций (с 1963) и отделом физической органической химии (1975–1987), директор (1987–1997) Новосибирского института органической химии им. Н. Н. Ворожцова СО АН СССР — РАН. Председатель Сибирского отделения, вице-президент АН СССР — РАН (1980–1997).

На посту руководителя Сибирского отделения и вице-президента АН СССР — РАН В. А. Коптюг внес огромный вклад в развитие Отделения и сохранение научного потенциала в новых постсоветских условиях.

Активно работал в Международном союзе по теоретической и прикладной химии (вице-президент, затем президент) и Научном комитете по проблемам окружающей среды (вице-президент) Международного совета научных союзов. Последовательный сторонник и пропагандист идеи устойчивого развития цивилизации.

Его фундаментальные труды объяснили механизмы ряда органических реакций, углубили понимание промышленных процессов переработки ароматических соединений. Прикладные работы Валентина Афанасьевича открыли путь новым способам получения различных групп соединений и их практическому использованию.

Он одним из первых начал внедрять в практику химических исследований новейшие физические методы, математическое моделирование. В результате его усилий по созданию компьютерных баз данных был организован Научно-технический центр химической информатики.

В. А. Коптюгу принадлежат более трехсот научных публикаций (в том числе четыре монографии), тридцать авторских свидетельств, пять зарубежных патентов; он был редактором серийного издания «Атласы спектров ароматических и гетероциклических соединений», ряда справочных руководств по молекулярной спектроскопии.

Библиотека оформлена в виде кабинета ученого и содержит более 2000 экземпляров книг и журналов. Это издания, которые В. А. Коптюг собирал всю свою жизнь. Поражает диапазон интересов ученого. В личной библиотеке, переданной в Отделение, представлены книги по всем отраслям знания — от химии, экологии и ядерной физики до политики, истории и законодательства.

Именем В. А. Коптюга назван проспект в Новосибирском Академгородке.

Именем В. А. Коптюга названо научно-исследовательское судно в составе Байкальского флота Лимнологического института СО РАН.

Отмечая выдающиеся заслуги Валентина Афанасьевича Коптюга, ГПНТБ СО РАН на базе своего отделения в Академгородке организовала Мемориальную библиотеку академика, в которую входит мемориальный кабинет ученого с его личной коллекцией книг и документным архивом, а также электронный ресурс, отражающий научные труды, публицистические статьи и выступления, документы, а также литературу о В. А. Коптюге.

Основу библиографических материалов составили биобиблиографические указатели, изданные ГПНТБ СО РАН в 1981, 1986, 1996 гг.

В ресурсе использованы материалы из книг «Наука спасет человечество» (Новосибирск, 1997), «Памяти Валентина Афанасьевича Коптюга» (Новосибирск, 1999), «Эпоха Коптюга» (Новосибирск, 2001), а также работы Р. И. Ахмерова, В. Т. Новикова, А. Н. Полякова и других фотожурналистов из фотоархивов Сибирского отделения РАН, ГПНТБ СО РАН, НИОХ СО РАН.