В первом сообщении [1] было показано, что шестнадцать двухбуквенных корней генетического кода распадаются на два октета: сильный и слабый (см. [1], табл.1). Однако порядок корней в каждом из октетов оставался еще произвольным. В настоящем сообщении мы покажем, что, привлекая дополнительную информацию о химической структуре аминокислот, можно установить канонический порядок в последовательности корней каждого октета (см. табл. 1).
Мы отмечаем, что четыре переходных корня [1] ГУ, УГ, АЦ, ЦА попадают в среднюю полосу и что три аминокислоты:
| Сер | Лей | Арг | Сильный | УЦ | ЦУ | ЦГ | Слабый | АГ | УУ | АГ |
кодируются двумя корнями - сильным и слабым каждая.
Для получения табл.1 мы, как это принято в литературе [2], разбиваем аминокислоты на девять классов по типам радикалов:
- Имино-: Про.
- Ароматические: Фен, Тир.
- Моноаминомонокарбоновые: Ала, Гли, Вал, Илей, Лей.
- Серусодержащие: Цис, Мет.
- Гетероциклические: Гис, Три.
- Амиды моноаминодикарбоновых: Аспн, Глун.
- Диаминомо-нокарбоновые: Apг, Лиз.
- Окси-моноаминокарбоновые: Тре, Сер.
- Моноаминодикарбоновые: Асп, Глу.
Сильные Окончания: Ц, Г, У, А | Слабые Ц, У: Окончания Г, А | Ала - ГЦ Гли - ГГ Арг - ЦГ
Вал - ГУ Тре - АЦ
Про - ЦЦ Лей - ЦУ Сер - УЦ | Тир - УА - (-) Фен - УУ - Лей Илей - АУ - Мет
Цис - УГ - Три Гис - ЦА - Глун
Аспн - АА - Лиз Сер - АГ - Арг Асп - ГА - Глу |
|
Мы отмечаем, что кодируемые слабыми корнями пары аминокислот всегда (за исключением пары Асп - Га - Глу) принадлежат к различным классам. Например, (5) Гис - Ца - Глун (6). Оказывается, что мы можем однозначно перенумеровать все девять классов таким образом, что кодируемые слабыми корнями пары аминокислот попадут в смежные классы. Мы получим следующую непрерывную цепочку + отдельное (девятое) звено:
Мы отмечаем, что кодируемая слабым корнем УА пара (Охр, Янт) попадает в первый класс иминокислот (у нас для этой пары принято обозначение (-)). Таким образом, мы установили канонический порядок корней в слабом октете.
Но порядок корней в слабом октете однозначно определяет порядок корней в сильном октете.
В самом деле, при перестановке слабые корни переходят в сильные и наоборот.
Содержащуюся в таблицах информацию мы можем представить следующим образом:
1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9 |
| | Ала | | | | | | |
| | Гли | | | | Арг | | |
| | Вал | | | | | Тре | |
Про | | Лей | | | | | Сер | |
(-) | Фен | Илей | Цис | Гис | Аспн | Арг | | Асп |
| Тир | Лей | Мет | Три | Глун | Лиз | Сер | Глу |
Здесь восемь аминокислот, кодируемых сильными корнями, напечатаны жирным шрифтом.
Мы отмечаем, что последняя таблица является не таблицей аминокислот, а скорее таблицей им соответствующих тРНК. В ней помещены обе уже отмеченные в литературе [3] лейциновые тРНК (сильная и слабая), а также обе пары аргининовой тРНК и обе пары сериновой тРНК.
Новосибирский государственный университет | Поступило 15.I.1969 (Представлено академиком М.А.Леонтовичем 20.I.1969) |
| ЦИТИРОВАННАЯ ЛИТЕРАТУРА |
|
[1] | | Ю.Б.Румер, ДАН, 181, N 1, 225 (1968). |
[2] | | Г.В.Гурская, Структура аминокислот, «Наука», 1966. |
[3] | | Дж.Уотсон, Молекулярная биология гена, М., 1967, стр.363. |
|