Член-корреспондент АМН СССР (1974), доктор медицинских наук (1958), профессор (1962). Физиолог и биофизик.

Закончил военный факультет Второго Московского медицинского института (1942).

Начальник санслужбы 87 гвардейского минометного полка («Катюши») в составе Воронежского, Юго-Западного, а затем — 3-го Украинского фронтов (1942–1945).

Аспирант НИИ нормальной и патологической физиологии АМН СССР (1945–1948), младший научный сотрудник, докторант, старший научный сотрудник этого института (1948–1958).

Зав. лабораторией биофизики, а также физического и инженерного секторов Всесоюзного НИИ медицинского инструментария и оборудования Минздрава СССР (1959–1962).

Зав. лабораторией физических методов исследования физиологических функций организма в Институте питания АМН СССР (1962–1972).

Заместитель председателя Президиума Сибирского филиала АМН СССР (1971–1974). Директор Института физиологии Сибирского филиала АМН СССР (1973–1977).

Развивал биофизическое направление изучения активных физических процессов и пассивных физических свойств живого организма с применением современных электронных методов исследования. Исследования М. А. Собакина посвящены, главным образом, проблемам физиологии желудочно-кишечного тракта, в частности, его моторной деятельности в процессе пищеварения, а также взаимодействию голодной и пищеварительной моторики. Им изучено электрическое поле желудка и дано обоснование возможности регистрации электрогастрограммы с дистальных участков тела, а также бесконтактной регистрации электрической активности желудка, разработаны принципиальные основы ультразвуковой интроскопии внутренних органов. Он одним из первых провел исследование инфракрасного излучения поверхности тела человека, сформулировал принцип образования тепловых полей кожи, которые отражают состояние внутренних органов.

Автор свыше 130 научных работ, в том числе одной монографии, 7 авторских свидетельств на изобретения.

Участник Великой Отечественной войны. Подполковник медицинской службы. Имеет государственные награды.