Действительный член РАН (2013), действительный член АМН СССР (1971), член-корреспондент АМН СССР (1969), доктор медицинских наук (1963), профессор (1963). Российский ученый в области медицины, биофизики, экологии, социологии, педагогики.

Окончил Новосибирский государственный медицинский институт (1950). Клинический ординатор (1950-1953), ассистент (1953–1956), доцент (1956–1963), профессор (1963–1964), заведующий кафедрой терапии (1950–1960), ректор Новосибирского государственного медицинского института (1964–1971).

Основное направление научных исследований — проблема адаптации человека к различным климатогеографическим и социально-производственным условиям. В. П. Казначеев одним из первых в отечественной науке начал развивать принцип системного подхода к проблеме адаптации человека. Сформулировал концепцию «синдрома полярного напряжения», в рамках которой удалось определить комплекс субмолекулярных, молекулярных, клеточных и системных изменений, возникающих в организме человека при воздействии на него экологических факторов Заполярья.

В. П. Казначеев — крупный организатор медицинской науки на востоке страны, координатор основных фундаментальных научных направлений в Сибири и на Севере. Под его руководством и при непосредственном его участии в 1970 г. создан Сибирский филиал АМН СССР и Институт клинической и экспериментальной медицины, на базе которого в разные годы сформировано шесть крупных институтов.

Председатель Сибирского филиала АМН СССР (1971–1980), директор Института клинической и экспериментальной медицины СО АМН СССР (1971–1992), директор Института общей патологии и экологии человека СО РАМН (1992–1998).

Автор более 800 научных работ, ряда изобретений и открытий.

Имеет многочисленные государственные награды. Почетный гражданин города Новосибирска (1998).

В СО РАН учреждена премия им. В. П. Казначеева для молодых ученых за работы в области общей патологии и фундаментальной медицины.