Действительный член РАН (2013), действительный член РАСХН (2005), доктор ветеринарных наук (1990), профессор (1990). Специалист в области ветеринарной медицины.

Окончил Алма-Атинский зооветеринарный институт (1965). После окончания института преподаватель (1965–1966) Актюбинского сельскохозяйственного техникума, инспектор-ветеринарный врач (1966–1968) Министерства охраны общественного порядка Казахской ССР, аспирант (1968–1971) Казахского научно-исследовательского ветеринарного института, директор (1971–1976) Гурьевской научно-исследовательской ветеринарной станции, старший научный сотрудник (1976–1979) Казахского научно-исследовательского ветеринарного института.

В мае 1979 г. A. C. Донченко переводится на работу в Институт экспериментальной ветеринарии Сибири и Дальнего Востока Сибирского Отделения ВАСХНИЛ (р.п. Краснообск Новосибирской обл.): заведующий лабораторией туберкулеза животных (1979–1988), заместитель директора по научной работе (1988–1996), директор (1996–2012) Института. Заведующий (с 1997 г.) кафедрой эпизоотологии и микробиологии Новосибирского государственного аграрного университета. Одновременно заместитель (1997–2001), первый заместитель (2001–2005), председатель (2005–2014) президиума СО Россельхозакадемии. С 2014 г. — заместитель председателя Сибирского регионального отделения РАН, председатель ФГБУ Сибирского отделения аграрной науки.

Является создателем научно обоснованных технологий, систем, ветеринарных диагностикумов и препаратов, призванных обеспечивать профилактику и ликвидацию распространенных в Сибири и за ее пределами хронических инфекций сельскохозяйственных животных.

Автор более 750 научных трудов, в том числе 51 монографии. Имеет 22 авторских свидетельств и патентов на изобретения.

Заслуженный деятель науки Российской Федерации (1998). Имеет государственные награды.