Пелагея Яковлевна родилась в Астрахани в 1899 году. Окончила физико-математическое отделение Петроградского университета. В Сибирском отделении с 1959 года. Действительный член, член-корреспондент АН СССР, доктор физико-математических наук, профессор. Математик, механик. Специалист в области гидродинамики. В СО РАН учреждена премия им. П.Я. Кочиной для молодых ученых.
Написала научные биографии трёх выдающихся математиков - С. Ковалевской, К. Вейерштрасса и Г. Миттаг-Леффлера. В своей книге «Воспоминания» (М.: Наука, 1974 г.) она рассказывает об учёных Новосибирска.