Екатерина Владимировна родилась 14 июля 1952 г. в Казахстане. Впервые оказалась в новосибирском Академгородке в 1968 г., приехав в летнюю Физико-математическую школу. В 1977 г. она окончила ММФ НГУ.
В своих книгах Екатерина Булгакова с любовью обращается к Университету, друзьям, памятным местам Академгородка.